Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CYBBP04839 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CYBBP04839 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CYBBP04839 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CYBBP04839 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms