Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNB1P01574 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms