Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP9BO43861 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms