Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MAP3K13O43283 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MAP3K13O43283 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms