Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
H3BNH8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H3BNH8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H3BNH8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H3BNH8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms