Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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C4orf47A7E2U8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C4orf47A7E2U8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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C4orf47A7E2U8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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C4orf47A7E2U8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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C4orf47A7E2U8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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C4orf47A7E2U8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C4orf47A7E2U8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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