Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPEF1Q9Y4P9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms