Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1Q9Y3L3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1Q9Y3L3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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