Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC8Q9Y2L5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms