Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LIMD1Q9UGP4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms