Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms