Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KCNK4Q9NYG8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNK4Q9NYG8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms