Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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HOXC10Q9NYD6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC10Q9NYD6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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