Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SDHAF3Q9NRP4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms