Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NXF3Q9H4D5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms