Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CEP295Q9C0D2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms