Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
HIGD2AQ9BW72 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms