Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RTKNQ9BST9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RTKNQ9BST9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms