Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LPIN3Q9BQK8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms