Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SPOCK3Q9BQ16 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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