Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT140Q96RY7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFT140Q96RY7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms