Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ZNF479Q96JC4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms