Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAAF4Q8WXU2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms