Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DNAJA4Q8WW22 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms