Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM41Q8WV44 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM41Q8WV44 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms