Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEDD1Q8NHV4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms