Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms