Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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