Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLIP4Q8N3C7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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CLIP4Q8N3C7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
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CLIP4Q8N3C7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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CLIP4Q8N3C7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLIP4Q8N3C7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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