Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEST3Q8N1M1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BEST3Q8N1M1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms