Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALYREFQ86V81 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms