Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms