Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC8EQ6NSJ5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms