Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RTL6Q6ICC9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms