Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDCA8Q53HL2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms