Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MSMPQ1L6U9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MSMPQ1L6U9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms