Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYPL1Q16563 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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