Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CST6Q15828 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CST6Q15828 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms