Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SIX1Q15475 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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