Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX3Q13761 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX3Q13761 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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