Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2Q13563 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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