Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE3BQ13370 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE3BQ13370 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms