Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGB3BPQ13352 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGB3BPQ13352 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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