Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXF1Q12946 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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