Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SMARCB1Q12824 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms