Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC15Q0P6D6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms