Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCBP1Q09161 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms