Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LRP1Q07954 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms