Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms