Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC10Q01780 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms